В РГГУ работают институты и центры, получившие широкое признание за рубежом: Институт высших гуманитарных исследований, Учебно-научный центр социальной антропологии, Центр типологии и семиотики фольклора, ряд международных учебно-научных центров и др. Труды научных сотрудников, работающих в этих структурах, известны и признаны как среди российских, так и среди зарубежных коллег.
- Международный институт новых образовательных технологий
- Международный научно-образовательный центр истории Холокоста и геноцидов
- Международный научный центр изучения Южной Азии
- Международный учебно-научный центр «Высшая школа европейских культур»
- Международный учебно-научный центр перспективных медиатехнологий
- Международный учебно-научный центр по изучению древних цивилизаций Египта и Судана им. В.С. Голенищева
- Международный учебно-научный Центр русского языка
- Научная лаборатория «Социальная психология личности»
- Научно-исследовательский центр интегративной и цифровой гуманитаристики
- Научно-образовательный центр
- Научно-образовательный центр «Гуманитарный архив»
- Научно-образовательный центр «Психология»
- Научно-образовательный центр когнитивных программ и технологий
- Отдел научных исследований Института восточных культур и античности
- Российско-германский учебно-научный центр
- Российско-китайский учебно-научный центр «Институт Конфуция РГГУ»
- Учебно-научная лаборатория мандельштамоведения
- Учебно-научная лаборатория социолингвистики
- Учебно-научная лаборатория фольклористики
- Учебно-научный инновационный центр проблем экономики, управления и права
- Учебно-научный институт высших гуманитарных исследований им. Е.М. Мелетинского
- Учебно-научный Мезоамериканский центр им. Ю.В. Кнорозова
- Учебно-научный Российско-итальянский центр
- Учебно-научный Российско-французский центр исторической антропологии им. Марка Блока
- Учебно-научный Российско-швейцарский центр
- Учебно-научный центр «Кремль – 9»
- Учебно-научный центр «Новая Россия. История постсоветской России»
- Учебно-научный центр «Философия Востока»
- Учебно-научный центр визуальных исследований Средневековья и Нового времени
- Учебно-научный центр европейских исследований
- Учебно-научный центр изучения религий
- Учебно-научный центр изучения этнополитических и этнокультурных процессов
- Учебно-научный центр интеллектуальной робототехники
- Учебно-научный центр компьютерной лингвистики
- Учебно-научный центр лингвистической типологии
- Учебно-научный центр междисциплинарных гуманитарных исследований
- Учебно-научный центр программного и лингвистического обеспечения интеллектуальных систем
- Учебно-научный центр региональной истории, краеведения и москвоведения
- Учебно-научный центр современных компаративных исследований
- Учебно-научный центр социальной антропологии
- Учебно-научный центр типологии и семиотики фольклора
- Учебно-научный центр феноменологической философии
- Учебно-научный центр фундаментальных и прикладных исследований восточных языков и культур
- Центр научного проектирования Управления по научной работе
- Центр теории текста и лингвистического обеспечения коммуникации